DCode DNA突变检测系统

系统功能灵活，适合多种突变检测方法

在癌症研究发展及多种单基因或多基因疾病的研究过程中，探索未知突变起着非常重要的作用。DNA 多态性 是物种的生态与进化研究非常有用的工具。应用范围包括物种鉴定、种群结构分析及遗传多样性研究等。

DCode 系统由带温度控制模块（包括微处理器控制加热）的电泳设备、一个缓冲液再循环泵、一个搅拌器及 铺制特殊应用凝胶的附件组成。冷却槽及一个外部实验室冷却器可把运行温度控制在室温下。一块凝胶能在2 个小 时内运行64 个样品，并提供5-70°C 范围内的精确温度控制。它可与下列的电泳技术配合使用来检测单碱基变化：

·      单链构象多态性（SSCP）

·      变性梯度凝胶电泳（DGGE）

·      时间温度梯度电泳（TTGE）

·      均一变性凝胶电泳（CDGE）

为了获得最高的通量和效率，许多实验室采用多种技术。在快节奏研究环境中，不同方法间的快速切换和转换到新技术的能力是非常关键的。DCode 系统能迎合所有主要突变检测技术的需要。其灵活的功能与优点包括：

·      温度控制选择

·      模块式设计，可满足用户现在与将来的需要

·      专用的组合配件，简化启动过程

·      针对特定技术的试剂和对照物，适合DGGE、CDGE、SSCP 和TTGE 等技术

运用DGGE搜寻未知突变

DGGE 是基于以下原理，即增加聚丙烯酰胺凝胶内变性剂的浓度会熔解双链DNA 的不同区域。当温度达到最低熔解度区域的熔解温度(Tm) 时，DNA 部分熔解，在凝胶中形成迁移率下降的分支分子（Myers et al.1987）。在均一的运行温度（50—65°C）和尿素与甲酰胺线性变性梯度条件下即形成了变性环境。梯度以垂直或平行于电泳方向形成。DGGE 是最灵敏的突变检测方法，其效率可达99%（Grompe 1993）。DCode 系统通过以下途径优化DGGE：

·      温度控制模块提供45–70°C 内的一致运行温度

·      系统可运行2 块16 x 16 cm 凝胶或4 块7.5 x 10 cm 凝胶

·      可选择的MacMelt 或WinMelt 软件优化了GC 夹及引物的置放

DGGE 的两种模式。A ，凝胶的变性梯度方向与电泳方向垂直。从原生乳腺癌种扩增的p53 基因6 号外显子的野生型和突变型等位基因通过垂直DGGE（80V，56°C，2 小时）分离。感谢AL Borresen, Radium Hospital, Oslo, Norway 提供的数据。B ，凝胶的变性梯度方向与电泳方向平行。p53 基因8 号外显子的野生型和突变型等位基因在8%丙烯酰胺：甲叉(37.5：1) 平行梯度（40–65% 变性剂）凝胶上，1 x TAE 缓冲液， 60°C，150 V，电泳2.5 个小时。左泳道，突变型等位基因；中，野生型等位基因；右，突变型与野生型等位基因。

DGGE分离示意图。所示为一个变性梯度方向与电泳方向垂直的凝胶，以及一个有单个熔解区域的目标序列。野生型和突变型样品加入到制备孔内。在低变性剂浓度时，DNA 片段为双链，但当浓度增加时双链DNA 开始熔解，形成分枝分子。到浓度非常高时，DNA 片段可熔解形成2条单链。

运用TTGE

TTGE 采用DGGE 的原理但不使用化学变性剂梯度，操作更简单、 快速并便于重复（Yoshino et al.1991）。DNA 上样于含尿素的聚丙烯酰 胺凝胶。电泳过程中逐步、均一地升高温度，从而在电泳运行过程中产生一个线性的温度梯度。变性环境由凝胶中均一的尿素浓度加上时 间温度梯度形成。DCode 系统使TTGE 简化为简单而可重复的实践。

·      温度控制器与加热器可使温度缓慢地以0.1°C/hr 的速度上升

·      无需化学梯度，使设置和制胶更方便

·      MacMelt 或WinMelt 软件帮助确定最佳温度范围

·      对照试剂与已证明有效的规程使你可以立即开展实验

TTGE 分离囊性纤维化基因(外显子7)的突变型和野生型等位基因。 使用50–60°C 的温度梯度和2°C/hr 的斜率，在130V, 1.25 x TAE 缓冲液，6M 尿素/ 6%（37.5:1）丙烯酰胺凝胶上电泳5 小时。 泳道1，突变型等位基因1154 insTC；泳道2，突变型等位基因 G330X；泳道3，突变型等位基因DF311；泳道4，突变型等位基因R334W；泳道5，野生型等位基因。感谢L Silverman, Divison of Molecular Pathology, University of North Carolina School of Medicine 提供样品。

运用CDGE 快速筛选

CDGE 是高通量筛选的有效方法。CDGE 凝胶的最佳变性剂浓度由垂直梯度凝胶决定。一旦确定了特定变异的最佳变性剂浓度，便可在均一变性凝胶上筛选多个样品(Borresen et al.1991)。因此，采用 CDGE 时无须使用梯度，使得快速高通量筛选变得简单。DCode 系统提供：

·      简化的规程，用于优化变性剂浓度

·      已经优化了的电泳试剂和对照物，确保高通量筛选的出色结果

·      方便的16 x 16 cm 和16 x 10 cm 格式及无需胶带的制胶，简化并加速了工作流程

CDGE分离beta-球蛋白基因的突变型和野生型等位基因。 含45% 变性剂的凝胶在56°C电泳。泳道1，突变样品混合物 IVS1-1/IVS1-6；泳道2，突变样品IVS1-1；泳道3，突变样品 IVS1-6；泳道4，突变样品IVS1-110；泳道5，野生型DNA。有 关这个实验的详情，见资料＃2107。

SSCP 提供一致的结果

SSCP 因其简便性而被广泛地用于突变筛选。对一个特定样品， 我们无法预测其实验条件，因此为确保最高的灵敏度，优化凝胶电泳条件（包括运行温度）显得非常重要（Orita et al.1989, Ravnik–Glavac et al.1994）。Bio–Rad 的温度控制冷却槽保证提供可重复的运行温度，以产生一致性的结果。

·      电泳冷却槽带有陶瓷冷却棒，与标准外接的再循环冷却器相连

·      控温模块带有搅拌棒、加热器和缓冲液再循环泵，维持5–25°C 之间的均一温度

·      DCode 系统也可放置在低于室温的冷库，来代替冷却槽，

·      可容纳16 x 16 cm 和16 x 20 cm 大小的凝胶，简化了银染或荧光染色的检测

SSCP 分离p53 基因(外显子8) 的突变型和野生型等位基因。在30W 恒功率，8°C，1 x TBE 缓冲液，含3.5% 甘油的8% （37.5:1）丙烯酰胺凝胶上电泳3.5 个小时。泳道1，未变性突变型等位基因；泳道2，突变型等位基因；泳道3，野生型等位基 因；泳道4，未变性野生型等位基因。

目录 #	描述
DCode Systems
170-9080	DCode System for DGGE, 120 V, for 16 cm gels with single prep well (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9081	DCode System for DGGE, 220/240 V, for 16 cm gels with single prep well (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9082	DCode System for DGGE, 100 V, for 16 cm gels with single prep well (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9083	DCode System for DGGE, 120 V, for 10 cm gels with 2 prep wells (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9084	DCode System for DGGE, 220/240 V, for 10 cm gels with 2 prep wells (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9085	DCode System for DGGE, 100 V, for 10 cm gels with 2 prep wells (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9086	DCode System for CDGE, 120 V, for 16 cm gels with 20 wells (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels
170-9089	DCode System for TTGE, 120 V, for 16 cm gels with 20 wells (1 mm), includes comb gasket, 2 sets of clamps, Model 475 gradient former, all parts required to cast gradient gels, control reagents for TTGE
170-9090	DCode System for TTGE, 220/240 V
170-9091	DCode System for TTGE, 100 V
上海创萌生物科技有限公司 吴先生 [联系时请说明来自检测通] 在线客服： 留言咨询 联系方式： 请点击查看电话 邮件： 发送邮件 地址： 上海市闸北区河南北路485号银历大厦508室 推荐产品 2100生物分析仪 蛋白质分析 DN AE-6750S 制备电泳 1334188962 BT-100优质基本型蠕动泵/恒流 BT-300优质分配型蠕动泵/恒流 DY30K大称量精度1g电子天平|SL GDYN-110SB便携式农药残毒快速 Hema4800型/ TC-48/T/H(a)/TL9 Hyclone 胎牛血清 METTLER梅特勒-托利多FE20/FE2 NDJ-1S数显粘度计粘度测量范围 Rayto雷杜RT-6100全自动酶标仪 Sigma 8-氮杂鸟嘌呤 Sigma PEG3350 Sigma SDS 十二烷基硫酸钠 SR-2S/SR-2W强力振荡器 150005 关于检测通 | 服务项目 | 合作中心 | 资讯投稿 | 媒体聚焦 | 联系我们 | 客服中心 | 网站地图 | 友情链接 Copyright © 2010-2016 生意宝检测通 版权所有.浙ICP备14007955号 浙公网安备 33010602010408号 地址：浙江省杭州市莫干山路187号易盛大厦12F 邮政编码：310012 客服QQ:2804879579 检测通QQ群:检测资源-询盘、人脉 319379593 检测通手机版 检测通官方微信  检测通QQ群