主要技术指标:1、芯片扫描仪性能激光共聚焦扫描,提供更高的扫描分辨率和灵敏度,双色激光,波长为532nm and 635 nm,扫描仪分辨率<1um,自动进行定位,无须手工校准,自动获取数据,16 bit; 4个数量级线性范围,扫描仪符合CE认证2、芯片性能探针在结合到芯片前,经过质谱或者毛细管电泳对其碱基序列的长度和组成进行检测,质控,芯片上的每点附着有70万个探针,每点(含70万探针分子)又有平均30个重复,且随机分布在芯片上,保证高重复性,避免系统偏差,探针合成后经质控纯化,全长序列接近100%,提供每点出厂前检测的质控数据,每平方厘米400万点3、基因表达研究性能指标一轮反转录(IVT)条件下,需50-100ng(纳克)总RNA,检测灵敏度0.15 pM(99%可信度),重复性>0.99,与RT PCR相关系数>0.93,探针长度50个核苷酸,满足高特异性的要求,一个转录本一个探针,探针经过高特异性和灵敏度筛选,保证实验数据的可靠,提供高并行性/重复性的实验条件,在同一张芯片上可同时运行6或8个样品(全基因组芯片),人全基因组芯片探针数量48000,2006年数据库信息:RefSeq版本17/UniGene版本188,芯片杂交体积15-30µl,全基因组芯片价格不高于200美金/样本,可以在全基因组研究后对特定基因进行针对性研究,每个样品可研究700个基因4、基因分型SNP研究性能指标根据研究需要自由选择SNP位点进行研究,不受限制性内切酶的位点限制,不受浓度高低的限制,单个样品可同时进行96,384,768,1536个位点的研究,满足不同研究需要对低,中,高的不同位点数要求,每张芯片数据得率(call rate)>99%,数据重复性>99%,无需任何扩增情况下250ngDNA样品,无需PCR扩增,磁珠分离,无需过柱,实验过程简单,厂家提供免费生物信息学工作站挑选,同时进行>50个样品的实验,满足疾病-对照实验的高并行性要求5、全基因组SNP分型研究芯片单张芯片包含550K个SNP位点,SNP位点均匀分布,覆盖全基因组范围,没有盲区,全基因组覆盖率在中国人群中0.91,白人中为0.93,无需要用限制性内切酶将全基因组DNA分段,无需电泳检查反应情况,全部采用标签tagSNP,一个tagSNP涵盖周围高度连锁的SNP的信息,包含>7000个非同义SNP, >1500个MHC SNP, >150个线粒体SNP,必须具备LOH和基因拷贝数分析,具配对分析功能(pairwisetest),可直接比对分析正常-疾病样本的LOH区域差异,具备全基因组/全染色体观察工具,全染色范围内对LOH区域进行直观分析,缩放查看
主要附件及功能:全基因组表达谱研究定制SNP研究全基因组SNP研究基因拷贝数变化和杂交性缺失研究
主要应用领域:生物医学,医药
检测项目:基因诊断分析、多基因病致病基因的关联分析、基因组表达谱分析、MicroRNA表达谱分析
仪器联系人:胡正茂
联系人电话:0731-84805359